深圳2022年4月29日 /美通社/ -- 2021年底,承啟生物首席科學家、暨南大學張弓教授當選國際人類蛋白質組計劃執行委員會常務委員,這是目前在這一國際大型合作項目中,中國人任職的最(zui)高(gao)職位。與此同時,張弓教授還被任命領導8號染色體編碼蛋白質的研究,加上此前暨南大學何慶瑜教授已被任命領導20號染色體編碼蛋白質的研究,至此,暨南大學承擔了中國大陸三分之二的蛋白質研究任務,成為中國人類蛋白質組計劃的最大承擔(dan)單位。
國際(ji)人(ren)類(lei)蛋白(bai)質(zhi)組(zu)計(ji)劃執(zhi)行委(wei)員(yuan)會常務(wu)委(wei)員(yuan)、承啟生物首(shou)席科(ke)學家、暨南大學教授張弓
以多項領先科研成果 在全球學術舞臺上發出"中國聲音"
蛋白(bai)(bai)質(zhi)(zhi)是組(zu)(zu)成人(ren)(ren)體一切細胞、組(zu)(zu)織的(de)必要成分,是生(sheng)命活(huo)動的(de)實(shi)際(ji)承擔者(zhe)。在(zai)人(ren)(ren)類基(ji)因(yin)(yin)(yin)組(zu)(zu)計劃(hua)(hua)完成后(hou)(hou),人(ren)(ren)類基(ji)因(yin)(yin)(yin)組(zu)(zu)各(ge)基(ji)因(yin)(yin)(yin)及其功能都有(you)待在(zai)蛋白(bai)(bai)質(zhi)(zhi)層(ceng)面予(yu)以(yi)揭示和闡明。事實(shi)上,蛋白(bai)(bai)質(zhi)(zhi)組(zu)(zu)比基(ji)因(yin)(yin)(yin)組(zu)(zu)復雜得(de)多(duo)。據專(zhuan)家估計,人(ren)(ren)類基(ji)因(yin)(yin)(yin)組(zu)(zu)上約2萬(wan)個基(ji)因(yin)(yin)(yin)可變化出(chu)高達數百萬(wan)種(zhong)蛋白(bai)(bai)質(zhi)(zhi)形體(Proteoforms),因(yin)(yin)(yin)此系統性研(yan)究(jiu)人(ren)(ren)類蛋白(bai)(bai)質(zhi)(zhi)組(zu)(zu)勢在(zai)必行。為(wei)此,國際(ji)上成立(li)了人(ren)(ren)類蛋白(bai)(bai)質(zhi)(zhi)組(zu)(zu)計劃(hua)(hua)(Human Proteome Project, HPP),這是人(ren)(ren)類基(ji)因(yin)(yin)(yin)組(zu)(zu)計劃(hua)(hua)之后(hou)(hou)的(de)又一大(da)型國際(ji)科(ke)學合作項(xiang)目。2012年,"染(ran)色體中(zhong)心的(de)人(ren)(ren)類蛋白(bai)(bai)質(zhi)(zhi)組(zu)(zu)計劃(hua)(hua)(CHPP)"作為(wei)HPP的(de)核心正式(shi)啟(qi)動,其主要目的(de)是鑒定所有(you)人(ren)(ren)類蛋白(bai)(bai)質(zhi)(zhi),迄今(jin)為(wei)止仍在(zai)進行中(zhong)。
此(ci)次,張弓教(jiao)授被任命為國(guo)際人類蛋白(bai)質組計劃執行委員會常(chang)務委員,表明(ming)中國(guo)關于人類蛋白(bai)質的研究已躋(ji)身世界前列,并(bing)獲得國(guo)際學術界的高(gao)度(du)認可,徹底(di)掌握(wo)該領域的核心話(hua)語權。
事實上,此次張(zhang)弓教(jiao)授的(de)當(dang)選絕(jue)非偶然,自2013年開始(shi),張(zhang)弓教(jiao)授就和其(qi)他中國科學家一起(qi),在人類蛋白質研(yan)究領域中不斷(duan)發(fa)出中國聲(sheng)音。
HUPO2014大(da)會上,張(zhang)弓(gong)教授與國(guo)(guo)際人(ren)類(lei)蛋白質組計(ji)劃的發起人(ren)Young-Ki Paik(韓國(guo)(guo)延(yan)世大(da)學(xue)教授)在完成翻譯組學(xue)的特邀報(bao)告(gao)后(hou)合(he)影
2013年,張弓教(jiao)(jiao)授(shou)團隊(dui)研發成功翻(fan)譯組(zu)(zu)(zu)(zu)(zu)測序技(ji)術(shu)(shu),并與王通(tong)教(jiao)(jiao)授(shou)、何慶瑜教(jiao)(jiao)授(shou)研究組(zu)(zu)(zu)(zu)(zu)一同提出,翻(fan)譯組(zu)(zu)(zu)(zu)(zu)測序可以為蛋(dan)白(bai)質組(zu)(zu)(zu)(zu)(zu)質譜解(jie)析(xi)提供獨立而精密的(de)參(can)考信息,從(cong)而極大提高解(jie)析(xi)蛋(dan)白(bai)質組(zu)(zu)(zu)(zu)(zu)的(de)能力。該技(ji)術(shu)(shu)于2014年被(bei)作為CHPP的(de)核心支柱(zhu)之一,并在同年被(bei)人類蛋(dan)白(bai)質組(zu)(zu)(zu)(zu)(zu)組(zu)(zu)(zu)(zu)(zu)織列為國際人類蛋(dan)白(bai)質組(zu)(zu)(zu)(zu)(zu)計(ji)劃(hua)的(de)首要突出貢(gong)獻;
2018年,張弓教授等人在核心生物期刊Nucleic Acids Research(《核酸研究》)上發表了目前最(zui)全的(de)翻譯組(zu)學數據庫TranslatomeDB,該數據為(wei)蛋白質組(zu)研究提供了重要的參照資源和獨立質控數據源;
2019年(nian),張弓(gong)教授(shou)、王通教授(shou)、何慶(qing)瑜教授(shou)研究組(zu)(zu)(zu)通過(guo)翻(fan)(fan)譯組(zu)(zu)(zu)測序和蛋(dan)(dan)白質(zhi)組(zu)(zu)(zu)質(zhi)譜技術,發現了(le)數千個(ge)此前被(bei)認為(wei)的"非編碼RNA"實(shi)際上可翻(fan)(fan)譯出(chu)(chu)蛋(dan)(dan)白質(zhi)。該(gai)研究系統性地重(zhong)新(xin)注釋了(le)人類基因組(zu)(zu)(zu),打開了(le)一個(ge)全新(xin)的人類"暗(an)蛋(dan)(dan)白質(zhi)組(zu)(zu)(zu)"世界,也為(wei)研究各種(zhong)重(zhong)大疾病的機制、研發新(xin)型診斷(duan)和治療方法(fa)探索出(chu)(chu)了(le)更多可能。
翻(fan)譯組(RNC-mRNA)被作為國際人類蛋(dan)白質(zhi)組計(ji)劃(hua)的核心支柱之一。Reprinted with permission from J. Proteome Res. 2014, 13, 1, 50–59. Copyright 2014 American Chemical Society.
由于其突出貢獻,張(zhang)(zhang)弓教授(shou)(shou)被推選為(wei)2022-2024年CHPP新(xin)一屆執行委員會(hui)常委。此次張(zhang)(zhang)弓教授(shou)(shou)在(zai)國(guo)際(ji)舞臺上榮膺國(guo)際(ji)人(ren)類蛋(dan)(dan)白質組(zu)計劃執行委員會(hui)常務(wu)委員,亦是對其在(zai)過(guo)去10年不斷(duan)在(zai)翻(fan)譯組(zu)測(ce)序技術(shu)和蛋(dan)(dan)白質組(zu)質譜技術(shu)相關領域(yu)的肯(ken)定(ding)。未(wei)來,在(zai)以張(zhang)(zhang)弓教授(shou)(shou)為(wei)首(shou)的中(zhong)國(guo)科學(xue)家帶領下(xia),中(zhong)國(guo)的人(ren)類蛋(dan)(dan)白質研究還將(jiang)取得(de)更多新(xin)突破,為(wei)解(jie)密人(ren)體(ti)的"健康密碼"貢獻更多力量。
以技術創新破局 促推行業發展
在學術研究者(zhe)的身(shen)(shen)份之(zhi)外,張弓教(jiao)授的另(ling)一(yi)個身(shen)(shen)份是承啟生物的聯合創始人(ren),在其帶領(ling)下(xia),承啟生物也(ye)不斷為國際人(ren)類蛋白質組計劃貢獻企業力量。
作為(wei)一家致力(li)于用基因(yin)科技為(wei)人(ren)(ren)們提(ti)供精準醫療及(ji)健康管理服務的(de)科技公司,承(cheng)啟(qi)生物建(jian)立了極(ji)為(wei)豐(feng)富的(de)翻譯(yi)組(zu)(zu)學(xue)研究,是目前僅少數能提(ti)供多物種翻譯(yi)組(zu)(zu)測(ce)(ce)序(xu)及(ji)分析,并(bing)掌握著(zhu)一系(xi)列翻譯(yi)組(zu)(zu)測(ce)(ce)序(xu)技術(shu)專(zhuan)利的(de)公司,得(de)益于此,2017年,承(cheng)啟(qi)生物宣(xuan)布(bu)為(wei)國際人(ren)(ren)類(lei)蛋白質(zhi)組(zu)(zu)計劃免費(fei)提(ti)供翻譯(yi)組(zu)(zu)測(ce)(ce)序(xu)服務,助力(li)國際人(ren)(ren)類(lei)蛋白質(zhi)組(zu)(zu)計劃早日完(wan)成。
張(zhang)弓教授受邀在(zai)HUPO2017大(da)會上作關于發現人類“暗蛋白(bai)質(zhi)組”的(de)專題報告,并在(zai)會上宣布承(cheng)啟生物將為國際人類蛋白(bai)質(zhi)組計(ji)劃免費(fei)提供翻(fan)譯組測序服務
自2022年起,國際人類蛋白質組計劃的官方數據庫neXtProt的亞洲分站也由承啟生物建設、運營和維護。這是國際人類蛋白質組計劃第一次(ci)將官方數據(ju)庫(ku)交由亞洲公(gong)司運維,需要團隊具(ju)備海量組(zu)學數(shu)(shu)據(ju)(ju)的(de)精準處理能力和超大(da)型生(sheng)物信息數(shu)(shu)據(ju)(ju)庫(ku)的(de)運維能力。最(zui)終,選由承(cheng)(cheng)啟(qi)生(sheng)物作為該數(shu)(shu)據(ju)(ju)庫(ku)的(de)承(cheng)(cheng)接者,對于(yu)中國在國際人類蛋白質組(zu)計劃中核心地(di)位的(de)提升具(ju)有重大(da)意(yi)義(yi)。4月,位于(yu)瑞士的(de)neXtProt數(shu)(shu)據(ju)(ju)庫(ku)團隊開(kai)始向承(cheng)(cheng)啟(qi)生(sheng)物同(tong)步現(xian)有數(shu)(shu)據(ju)(ju)。
如果說,張弓教授是承啟生物的主心骨,那么其原創的"中國造"FANSe算法就是承接HPP官方數據庫建立的基石。FANSe系列核酸測序算法是迄今為止穩健性和準確性最高(gao)的比對(dui)算法,同時具備(bei)很高(gao)(gao)(gao)的(de)(de)容錯性,被CHPP指定為(wei)(wei)核心支柱的(de)(de)推(tui)薦(jian)算(suan)法(fa),可單機(ji)5分(fen)鐘分(fen)析完一(yi)個人全基因組測(ce)序數據集,刷新世界紀(ji)錄。FANSe算(suan)法(fa)另一(yi)個特(te)性是(shi)全自主(zhu)開(kai)發,這使得(de)其可移植性和(he)擴展(zhan)性幾(ji)乎沒有任何限制,可高(gao)(gao)(gao)效運行(xing)于全國(guo)(guo)產(chan)的(de)(de)計算(suan)機(ji)上,在目前國(guo)(guo)際貿易爭端(duan)形勢嚴(yan)峻的(de)(de)情況下,無論在軟件(jian)還是(shi)硬(ying)件(jian)層(ceng)面,使用FANSe算(suan)法(fa)都(dou)不會(hui)被國(guo)(guo)外卡脖子。以FANSe算(suan)法(fa)為(wei)(wei)基礎,張弓教授團隊和(he)承啟生(sheng)物陸續成功(gong)研發了(le)一(yi)系列高(gao)(gao)(gao)精度(du)算(suan)法(fa)和(he)實驗(yan)方案,橫跨核酸測(ce)序、蛋(dan)白質組、代謝組等(deng),建立了(le)完整的(de)(de)國(guo)(guo)產(chan)化全組學高(gao)(gao)(gao)性能、高(gao)(gao)(gao)精度(du)分(fen)析體(ti)系,確保了(le)中(zhong)國(guo)(guo)精準醫學的(de)(de)精準與安全。
未來,承啟(qi)生物(wu)將(jiang)繼續(xu)依托自(zi)身的技(ji)術優勢和資源,將(jiang)更多更創新的基(ji)因測序、翻譯(yi)組(zu)學(xue)、蛋白(bai)(bai)質組(zu)學(xue)等技(ji)術應(ying)用于(yu)臨床與科研,為全面解析人類(lei)蛋白(bai)(bai)質組(zu)貢獻一己之(zhi)力,推動"以(yi)蛋白(bai)(bai)質組(zu)學(xue)驅(qu)動精準醫學(xue)"的發展(zhan)。