深圳(zhen)2023年8月(yue)7日 /美通社/ -- 日前,國際人類蛋白質組計劃官方數據庫neXtProt亞洲分站(//nextprot.cn/)由深圳(zhen)承啟(qi)生物(wu)科技有限公司(下稱承啟(qi)生物(wu))建設完成(cheng),提供全功(gong)能(neng)的(de)公共服(fu)務。這標志著中國擁有全部的(de)人(ren)類蛋白質組公共數據,將(jiang)極大地提升中國和(he)其他亞(ya)洲國家利用人(ren)類蛋白質組計劃成(cheng)果的(de)便捷性,助力人(ren)類健康和(he)疾病的(de)研(yan)究。
國際(ji)人類(lei)(lei)(lei)(lei)(lei)蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)質(zhi)(zhi)組(zu)計(ji)劃(hua)(Human Proteome Project)是(shi)人類(lei)(lei)(lei)(lei)(lei)基因(yin)(yin)組(zu)計(ji)劃(hua)之后(hou)的(de)(de)又(you)一重(zhong)大(da)(da)國際(ji)合(he)作(zuo)大(da)(da)科學(xue)(xue)(xue)計(ji)劃(hua),旨(zhi)在鑒(jian)定所有人類(lei)(lei)(lei)(lei)(lei)基因(yin)(yin)組(zu)編碼蛋(dan)(dan)白(bai)(bai),繪制人體(ti)(ti)蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)質(zhi)(zhi)圖譜(pu),作(zuo)為研究蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)質(zhi)(zhi)分(fen)子功能、推進疾病的(de)(de)診斷和治療(liao)的(de)(de)重(zhong)要資源。相比于人類(lei)(lei)(lei)(lei)(lei)基因(yin)(yin)組(zu)計(ji)劃(hua)時(shi)中國僅(jin)負(fu)責1%的(de)(de)測序工作(zuo),中國科學(xue)(xue)(xue)家(jia)在人類(lei)(lei)(lei)(lei)(lei)蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)質(zhi)(zhi)組(zu)計(ji)劃(hua)中的(de)(de)參與程度有了質(zhi)(zhi)的(de)(de)飛躍。目前(qian),中國科學(xue)(xue)(xue)家(jia)負(fu)責了人類(lei)(lei)(lei)(lei)(lei)三條染(ran)色(se)體(ti)(ti)上的(de)(de)蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)質(zhi)(zhi)研究,分(fen)別(bie)是(shi)1號染(ran)色(se)體(ti)(ti)、8號染(ran)色(se)體(ti)(ti)、20號染(ran)色(se)體(ti)(ti)。2022年起,暨(ji)南(nan)大(da)(da)學(xue)(xue)(xue)教(jiao)授、承啟生(sheng)物(wu)首席科學(xue)(xue)(xue)家(jia)張弓博士被選為國際(ji)人類(lei)(lei)(lei)(lei)(lei)蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)質(zhi)(zhi)組(zu)計(ji)劃(hua)的(de)(de)常委(wei),是(shi)唯(wei)一來自亞洲的(de)(de)常委(wei)。
國際人類蛋白質組計劃所產生的人類蛋白質數據載于neXtProt數據庫(www.nextprot.org),是目前人類蛋白質組最權威的數據庫,由瑞士生物信息學研究院(Swiss Institute of Bioinformatics)建立和維護。隨著中國科學界對蛋白質組高質量資源的需求與日俱增,洲際訪問neXtProt數據庫常常遇到速度緩慢和卡死狀況。為此,承啟生物從2021年末起承建neXtProt數據庫的亞洲分站(//nextprot.cn/)。但由于中國和歐洲(zhou)的(de)(de)(de)(de)網絡環(huan)境差異巨大,承啟生物(wu)做了許多調整與(yu)更(geng)改,復刻了主站的(de)(de)(de)(de)全部內容與(yu)結(jie)構(gou),方(fang)便用(yong)戶的(de)(de)(de)(de)使用(yong)習慣。同時,兩(liang)個(ge)數據(ju)庫的(de)(de)(de)(de)內容也會定期同步。亞洲(zhou)分站的(de)(de)(de)(de)建設完成,將大大提升中國和其他亞洲(zhou)國家(jia)利用(yong)這些高質量蛋(dan)白(bai)質數據(ju)的(de)(de)(de)(de)便捷程(cheng)度,對人類蛋(dan)白(bai)質的(de)(de)(de)(de)研究(jiu)、疾病機制研究(jiu)和藥物(wu)開發起到顯著的(de)(de)(de)(de)推(tui)動作用(yong)。
承(cheng)啟生物是HUPO(人類(lei)蛋(dan)白(bai)(bai)質組(zu)組(zu)織)的長期合作伙伴,在人類(lei)蛋(dan)白(bai)(bai)質組(zu)計劃中有很(hen)大的投入(ru)。承(cheng)啟生物以高精度的大規模測序(xu)比對算法FANSe系列和翻譯(yi)組(zu)測序(xu)技術(含RNC-seq, Ribo-seq)享譽業界,并為(wei)人類(lei)蛋(dan)白(bai)(bai)質組(zu)計劃免(mian)費(fei)提供翻譯(yi)組(zu)測序(xu)服務。