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基于英國和冰島人群研究的大規模蛋白質組學

deCODE genetics
2023-10-04 23:00 10250

在今天發布的一篇論文中,deCODE Genetics的科學家分享了他們使用基于親和力方法進行的血漿蛋白質組學研究結果。 們分析了在基因組序列中的疾病和多樣性背景下的蛋白質,并比較了使用兩個平臺測量的數千種蛋白質的結果,這些樣本分別來自英國生物銀行和冰島的大型群體。

冰島雷(lei)克雅未克2023年10月(yue)4日 /美通社/ -- 今天,制藥公司安進(Amgen)的子公司deCODE Genetics的科學家們在《自然》展示了血漿蛋白質組學可以如何幫助了解疾病。 該研究團隊專注于血漿蛋白質組,并從中發現了各種疾病與特定蛋白質水平之間的關聯。 deCODE genetics的科學家兼該論文的高級作者之一 Patrick Sulem 表示:"在基(ji)于人群(qun)的分組中(zhong)測(ce)量大量蛋白質可以發現循環中(zhong)的生物標志(zhi)物并及早(zao)檢(jian)測(ce)疾病。"


Kari Stefansson, Grimur Hjorleifsson and Patrick Sulem, scientists at deCODE genetics and authors on the paper.

此外,科學家們還利用影響蛋白質水平的遺傳因素來闡明序列變異關聯與疾病的發生原因之間的生物聯系。 "序列變異與疾病之間的生物關系往往難以捉摸。 將蛋白質基因組學納入分析可以發現疾病發展的分子機制。"deCODE genetics科學家 Kári Stefánsson 表示。

科學家們利用奧(ao)凌探(tan)索(Olink Explore)平(ping)臺(tai)上的(de)(de)2,941個免疫分析(xi)分析(xi)了(le)來(lai)自英國生(sheng)(sheng)物(wu)銀(yin)行的(de)(de)大約50,000份歐洲、非(fei)洲和亞(ya)洲血統個人的(de)(de)數據(ju)。 這(zhe)些數據(ju)由(you)英國生(sheng)(sheng)物(wu)銀(yin)行制藥(yao)蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)質組(zu)學項(xiang)目 (UKB-PPP)生(sheng)(sheng)成,這(zhe)是由(you)包括(kuo)安進(jin)在內(nei)的(de)(de)13家生(sheng)(sheng)物(wu)制藥(yao)公司組(zu)成的(de)(de)聯盟(meng),旨在研(yan)究(jiu)循環蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)的(de)(de)生(sheng)(sheng)物(wu)標志物(wu)。 作者將這(zhe)些研(yan)究(jiu)結果與先前的(de)(de)一項(xiang)研(yan)究(jiu)進(jin)行了(le)比較,他們在SomaScan平(ping)臺(tai)上使用了(le)4,907個基(ji)于(yu)適配體的(de)(de)分析(xi)方法分析(xi)了(le)大約40,000名(ming)冰島(dao)人的(de)(de)數據(ju)。 他們總共發(fa)現(xian)了(le)序列變(bian)異和蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)質水平(ping)之間的(de)(de)80,000多種關(guan)聯,以及超過500,000種疾病(bing)和其他蛋(dan)(dan)白(bai)(bai)質水平(ping)特征的(de)(de)關(guan)聯。

科(ke)學家們在使用兩個平(ping)臺(tai)檢查樣本的(de)其中一組(zu)子集時,觀(guan)察到其在蛋(dan)白質(zhi)水平(ping)測(ce)量結果上的(de)差異(yi) 。 這些平(ping)臺(tai)之間的(de)差異(yi)影(ying)響了循(xun)環疾病生物(wu)標志物(wu)的(de)發現,同時影(ying)響蛋(dan)白質(zhi)水平(ping)和疾病表(biao)現的(de)遺傳因素的(de)檢測(ce)。 通過對冰島和英國的(de)大型群體(ti)進行研究,大量的(de)關聯可(ke)以(yi)被檢測(ce)出(chu)來,也讓比較結果變得顯著。 作者團隊強調了逐個案例單獨分(fen)析的(de)價(jia)值(zhi)。

deCODE genetics首席執(zhi)行官兼(jian)該論文的高級作者之一Kári Stefánsson表示(shi):"雖然這兩個蛋(dan)白(bai)(bai)(bai)質(zhi)組學平(ping)臺是在大型數(shu)據集(ji)中同(tong)時測試數(shu)千種蛋(dan)白(bai)(bai)(bai)質(zhi)的實用工具,但(dan)我們仍(reng)需要對個體蛋(dan)白(bai)(bai)(bai)質(zhi)進行仔細驗證(zheng)。"

deCODE總部位于冰島雷克雅未克,是分析和理解人類基因組的全球領導者。 利用其獨特的專業知識和人口資源,deCODE發現了數十種常見疾病的遺傳風險因素。 了解疾病基因學是為了利用這些信息建立診斷、治療和預防疾病的新方式。deCODE是安進(納斯達克: AMGN)的全資子公司。

 

 

消息來源:deCODE genetics
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